Última actualización: 19/05/2022


Curso Académico: 2022/2023

Biología Computacional
(14159)
Titulación: Grado en Ingeniería Biomédica (257)


Coordinador/a: QUILEZ LOPEZ, CRISTINA

Departamento asignado a la asignatura: Departamento de Bioingeniería

Tipo: Obligatoria
Créditos: 6.0 ECTS

Curso:
Cuatrimestre:




Requisitos (Asignaturas o materias cuyo conocimiento se presupone)
Tener conocimientos de programación y fundamentos en Biología Molecular y Celular, y/o de Bioquímica.
Objetivos
El alumno adquirirá la capacidad de aplicar diferentes técnicas computacionales a resolver problemas complejos típicos de la biología y la medicina. Dichos problemas se caracterizan por implicar el análisis de grandes cantidades de información (búsqueda en bases de datos, análisis comparativos de secuencias de DNA, RNA, microRNAs y proteínas, búsqueda de dominios, evaluación de la patogenicidad de variantes, conservación evolutiva, filogenia..), de modo que en la práctica sólo son abordables mediante técnicas de computación intensiva, en las que se formará al alumno.
Competencias y resultados del aprendizaje
Descripción de contenidos: Programa
Los temas a tratar incluyen enfoques y técnicas computacionales para la búsqueda de la estructura genética, secuencia de alineación mediante uso de programación dinámica, predicción del plegado y la estructura de proteínas, interacciones de proteínas y medicamentos. Se revisarán distintos ejemplos de estudio en las distintas áreas y los estudiantes harán uso de herramientas de biología computacional para su análisis. Como parte de la asignatura, se investigarán las relaciones de la investigación en biología computacional con la biotecnología. Los temas a tratar incluyen: 1. Enfoques y técnicas computacionales para la búsqueda en bases de datos de secuencias, estructurales, de expresión y su relación con bases de datos de enfermedad. 2. Alineamiento y comparación de secuencias mediante uso de programación dinámica 3. Predicción de la estructura génica 4. Obtención de la secuencia proteica codificada 5. Predicción de estructura secundaria y análisis de plegamiento 6. Predicción de dominios funcionales y de unión a proteínas 7. Análisis de evolución molecular y filogenético de secuencias 8. Análisis de ligamiento y realización de mapas físicos para la identificación del gen asociado a enfermedad. 9. Análisis de la estructura del genoma, búsqueda de secuencias repetitivas y micrornas. 10. Evaluación de la patogenicidad de variantes en enfermedad. 11. Búsqueda de sitios de restricción y generación de vectores recombinantes in silico. Se revisarán distintos ejemplos de estudio en las distintas áreas y los estudiantes harán uso de herramientas de biología computacional para su análisis.
Actividades formativas, metodología a utilizar y régimen de tutorías
La metodología docente estará basada en clases presenciales e incluirá: -Clases magistrales, donde se presentarán los conocimientos que los alumnos deben adquirir y las herramientas bioinformáticas a utilizar. Para facilitar su desarrollo los alumnos recibirán las notas de clase y tendrán textos básicos de referencia que les facilite seguir las clases y desarrollar el trabajo posterior. Se incluirá la resolución de problemas tipo sobre la materia impartida. -Prácticas en laboratorio computacional para la resolución de los ejercicios mediante las herramientas bioinformáticas necesarias. -Clases presenciales para la resolución de dudas, tutorias y realización de las pruebas de evaluación continua.
Sistema de evaluación
  • Peso porcentual del Examen Final 60
  • Peso porcentual del resto de la evaluación 40
Calendario de Evaluación Continua
Bibliografía básica
  • - Lesk, A.M. Introduction to BioInformatics. Oxford University Press. Third Edition
  • - Mount, DW. Bioinformatics, Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor Laboratory Press. Second Edition

El programa de la asignatura podría sufrir alguna variación por causa de fuerza mayor debidamente justificada o por eventos académicos comunicados con antelación.